低温下喂食、温差过大、变质的食物、不洁的水质、不适合龟的食物、不合理的饲养方法、滥用长期使用或大剂量使用抗生素、寄生虫等等都会引起肠胃炎。
诊断：轻度病龟的便便稀软、呈黄色、绿色或深绿色、有少量粘液，并夹杂着不完全消化的食物。严重病龟的便便稀水样粘液状，呈酱色、血红色，并夹杂着不消化的食物，龟龟拒食。或排泄奇怪的便便。
1、低温下喂食、温差过大、不适合龟的食物等引起的肠胃炎的处理：
采取停食的方法，让龟龟的肠胃排空并进行自行调整。或口服生物制剂（如乳酸菌素片），帮助龟龟调整肠道菌群健全消化功能。
2、变质的食物、不洁的水质等引起的肠胃炎，细菌感染的可能性大。
处理： 口服或注射抗生素进行治疗。口服药物可以选择诺氟沙星或庆大霉素，注射药物可以选择庆大霉素注射液、乳酸环丙沙星注射液。
3、不合理的饲养方法。 以陆龟为例：吃了富含水分而缺少纤维素的食物引起大便松散稀薄，处理：适当控干食物中的水分、调整食物结构、加大粗纤维植物的比例。 再以陆龟为例：频繁的泡澡、过多的惊吓，刺激未消化、吸收的食物过早排泄。处理：减少泡澡次数、提供安静的饲养环境。
4、滥用、长期使用或大剂量使用抗生素引起的腹泻，伪膜性肠炎(抗生素肠炎)的可能性大。
处理：
a、较轻的腹泻，口服生物制剂,如乳酸菌素片，调整肠道菌群健全消化功能。
b、严重的腹泻，需要口服或注射抗生素进行治疗。首选替硝唑,次选甲硝唑。
5、常见寄生虫引起的大便松散稀薄。
处理：口服打虫药物。可以选用肠虫清。
6、果冻样等等奇怪的便便，原虫感染的可能性大。
处理：口服或注射替硝唑或甲硝唑，首选替硝唑,次选甲硝唑。
7、治疗调养期间，提供合理的饲养温度。
8、严重呕吐腹泻者，补充多维元素或使用补充电解质的专用药物，保证龟龟体内电解质的平衡。
治疗实例一 5、6克重的小草苗，估计是温差引起的肠炎，在水中漂浮，自行调整一个月无效，采用注射庆大的方法进行治疗，疗程5天，效果不错。疗程结束后的10天内偶尔还会浮起，不需要再用药物处理，让龟自行调整。
治疗实例二 低温引起的消化不良 1、停食5-7天，让龟龟的肠胃功能自行调整。 2、提高饲养温度。3、口服乳酸菌素片帮助调整肠胃功能。
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